Depois que Saber é devorada pela Sombra, Shirou Emiya abandona os próprios ideais para manter Sakura Matou em segurança enquanto a Quinta Guerra do Santo Graal se volta contra ele. Zouken, avô de Sakura, aperta o controle sobre a casa dos Matou, o ressentimento de Shinji cresce e Kirei Kotomine observa tudo da igreja. A cada noite a Sombra leva mais Masters de Fuyuki, e proteger uma única pessoa começa a custar a Shirou a promessa que Kiritsugu lhe deixou. Este segundo filme de Heaven's Feel continua diretamente de presage flower.