Enquanto o poder de Naraku cresce, InuYasha, Kagome Higurashi, Miroku, Sango e Shippo retomam a busca pelos últimos fragmentos da Joia de Quatro Almas. Sesshomaru trilha seu próprio caminho com a espada Tenseiga, e o destino de Kikyo segue entrelaçado com a missão do grupo. Com 26 episódios, esta temporada adapta os volumes finais do mangá de Rumiko Takahashi e encerra a história que o anime original de 2000 deixou em aberto.