Amu Hinamori é uma menina do ensino fundamental que os colegas chamam de 'cool and spicy', fachada que esconde o quanto ela é tímida. Numa manhã, ela acorda com três ovos coloridos que chocam e revelam os Guardian Characters Ran, Miki e Su, cada um trazendo à tona uma versão que ela gostaria de ser. Os Guardiões da escola a recrutam como Joker para caçar os Ovos X, os sonhos corrompidos de outros alunos. Por trás dessa caçada está a empresa Easter, atrás de um ovo capaz de realizar desejos chamado Embryo.