O aplicativo chamado Darwin's Game chega a Kaname Sudou pelo convite de um amigo, e só depois de entrar o estudante do ensino médio entende que aquilo é uma luta até a morte. Cada jogador recebe um Sigil, um poder pessoal, e pontos conquistados ao derrotar, ou matar, os outros. O Sigil de Kaname, o Martelo do Deus do Fogo, recria qualquer objeto que ele já tenha tocado, e precisa ser dominado às pressas quando a duelista Shuka Karino vai atrás dele. Cercado por esse mundo oculto, ele decide encontrar quem comanda o jogo.