Não querer amigos organiza a vida inteira de Yuuji Yugami, do lugar na sala até o jeito de atuar como ás do beisebol do colégio Kamihoshi sem nunca se enturmar com o time. Ao lado dele senta Chihiro Watanuki, uma garota que trocou tantas vezes de escola que nunca conseguiu manter uma amizade; enquanto ela tenta montar um círculo normal, esbarra repetidas vezes na franqueza distante de Yugami. Mesmo sem querer, ele acaba a guiando pela rotina escolar.