O frasco precisa ser preenchido com os fragmentos curados dos corações feridos das pessoas, que viram balas konpeito: é esse o contrato que pode levar Kobato Hanato ao lugar aonde ela tanto quer chegar. Alegre e desajeitada, ela conta com Ioryogi para guiá-la e ralhar com ela, um espírito ranzinza preso no corpo de um cachorro de pelúcia azul. Ajudando estranhos pela cidade, Kobato acaba se envolvendo com uma creche em dificuldades e com quem cuida do lugar.