Kazuki Muto morre ao tentar salvar Tokiko Tsumura de um homúnculo, um monstro alquímico que se alimenta de humanos. Tokiko, guerreira de uma ordem de alquimistas, o ressuscita substituindo seu coração destruído por um kakugane, um dispositivo que assume a forma de uma arma de acordo com quem o usa. Carregando um buso renkin em formato de lança, Kazuki se junta a Tokiko para caçar os homúnculos e o alquimista mascarado que os cria.