Dois volumes percorrem a vida de Itachi Uchiha dos quatro aos treze anos, retratando o que ele testemunhou da guerra e o caminho que o levou à Akatsuki, com material inédito sobre pessoas próximas a ele, como Shisui e seu pai, Fugaku. Um terceiro volume muda o foco para Sasuke Uchiha, acompanhando-o depois que a história de Itachi termina. Os volumes de Itachi saíram em inglês como Naruto: Itachi's Story, e a série desenvolve decisões que o mangá original deixou apenas insinuadas.