Kamun, o pai distante de Kanna Kamui, chega vindo do Mundo dos Dragões exigindo que ela retorne para responder por um erro do passado, deixando-a dividida entre a vida humana construída ao lado de Kobayashi e a guerra que se forma entre as facções dragão do Caos e da Harmonia. Kobayashi se recusa a deixar Kanna ir sem lutar, enquanto a também dragoa Iruru descobre que alguém está manipulando os dois lados por trás dos panos. Este filme dá continuidade à história de Kobayashi-san Chi no Maid Dragon S.