Homura Akemi leva uma vida luminosa e comum em Mitakihara ao lado de Madoka Kaname, Sayaka Miki, Kyoko Sakura e Mami Tomoe: as cinco formam um time de garotas mágicas que segura criaturas chamadas Nightmares. A calmaria começa a rachar quando Homura repara em detalhes fora do lugar, como os rostos embaçados na escola ou uma cidade da qual ela e Kyoko não conseguem sair por mais caminhos que tentem. Este mangá, desenhado por Hanokage, adapta o filme de 2013 Rebellion.