Depois de sobreviver a um ataque Savage, Hayato Kisaragi entra para Little Garden, uma academia montada sobre um enorme navio de guerra, para treinar no uso do Hundred, o único armamento capaz de ferir os invasores. Seu colega de quarto, Emile Crossfode, parece conhecê-lo de algum lugar e não diz de onde, enquanto Claire Harvey, presidente do grêmio estudantil e a Slayer mais forte a bordo, o desafia para um duelo assim que ele chega. Hayato luta tanto por dinheiro quanto por glória: o tratamento da irmã depende disso.