O professor Spencer Hale desaparece ao se aventurar na dimensão dos enigmáticos Unown, deixando sua filha Molly com tábuas de pedra marcadas com seus símbolos. Ao montá-las, as tábuas invocam os Unown, que criam uma ilusão de Entei para servir de pai substituto e transformam a mansão de Molly em um palácio de cristal. Quando Ash Ketchum, Misty e Brock chegam a Greenfield e Entei sequestra a mãe de Ash para completar a família imaginária de Molly, o grupo precisa atravessar a torre de cristal para trazer mãe e filha de volta. Este mangá adapta o terceiro filme de Pokémon.