Ao herdar a velha mansão do avô, na Inglaterra do pós-guerra, o ex-piloto da Real Força Aérea Hugh Anthony Disward também assume a guarda de um acervo de 900.666 livros proibidos, os Livros Fantasmas. Quem protege esse acervo é Dalian, uma garota conhecida como a 'Princesa Negra dos Livros', e os dois passam a investigar os incidentes causados por cada tomo perdido. Este mangá adapta as light novels originais.