Yuki Nagato sempre teve dificuldade para se expressar perto de outras pessoas, mas ao lado de Kyon, o único garoto do clube de literatura de apenas três membros, ela hesita ainda mais que o normal. Ambientado no mundo alternativo de vida escolar do arco "O Desaparecimento" de Haruhi Suzumiya, o mangá acompanha Yuki, Kyon e Ryouko Asakura, a melhor amiga dela, na rotina do clube, com Haruhi Suzumiya e o resto do elenco conhecido aparecendo em volta enquanto os sentimentos de Yuki aos poucos ficam claros.