Na remota aldeia de Hinamizawa, o recém-chegado Keiichi Maebara passa tardes tranquilas jogando com suas colegas Rena Ryugu, Mion Sonozaki, Rika Furude e Satoko Hojo. Mas ele descobre que uma série de assassinatos e desaparecimentos atinge a aldeia todos os anos durante o Festival Watanagashi, todos ligados à divindade local Oyashiro-sama. As amigas que ele pensava conhecer começam a agir de forma estranha. Keiichi não consegue dizer se o perigo vem de fora ou está sentado bem ao lado dele.