Em 2035, Aiko Tachibana, de quinze anos, vive há dois anos de luto pela família que perdeu no 'Burst', uma catástrofe de bioengenharia que isolou o Desfiladeiro de Kurobe atrás de um muro de vida sintética descontrolada chamada Matter. Então o aluno transferido Yuuya Kanzaki revela que ela pode ser uma duplicata criada a partir de uma garota ainda presa dentro da zona de quarentena. Aiko decide entrar no restrito Ponto Primário, guiada por Yuuya e uma equipe de mergulhadores, para descobrir o que realmente aconteceu no dia em que o Burst começou. Este mangá adapta o anime original da Netflix.