Tomoharu Natsume parece um colegial comum, mas é assombrado pelo fantasma de uma garota chamada Misao Minakami, morta anos antes. Ao se mudar para uma casa chamada Meioutei, sua vida tranquila acaba quando Shuri Kurosaki lhe entrega um misterioso baú deixado pelo irmão mais velho, um objeto que atrai a atenção de Kanade Takatsuki, uma garota vestida de miko, e arrasta Tomoharu rumo a uma verdade oculta sobre o mundo. Este mangá adapta a série original de light novels.