Sonic e seu amigo Tails recebem um aviso: o presidente de South Island e sua filha estão reféns do Dr. Robotnik, que garante ter sido expulso de sua própria cidade, Robotropolis, por um rival chamado Metal Robotnik. Com dúvidas, mas curiosos, Sonic e Tails entram em Robotropolis para desligar um gerador de energia fora de controle e enfrentar o impostor, só para descobrir que esse rival está mais ligado a Robotnik do que parece. O que começa como um resgate termina sendo uma armadilha montada pelo próprio Robotnik.