Há vinte e dois anos, um desastre sísmico batizado de Grande Levante dividiu Yokohama em dois territórios, isolando uma região chamada Lost Ground. Nela sobrevive Kazuma Torisuna, um mercenário sem lei que usa Shell Bullet, um Alter que transforma seu braço em arma viva, para se virar como pode. Quando Ryuho, agente da organização HOLY, invade o Lost Ground caçando Alters não autorizados, o confronto com Kazuma arrasta os dois para a guerra entre os marginalizados do Lost Ground e a ordem imposta pelo Mainland.