Apollo parece um humano comum até começar a recordar fragmentos da vida de Apollonius, um Anjo da Sombra que um dia amou uma mulher humana e se voltou contra os próprios semelhantes. Ao lado de seus companheiros, ele enfrenta os Anjos da Sombra, seres ancestrais que voltaram doze mil anos depois para colher a energia vital da humanidade, numa história construída em torno dessa antiga traição e de suas consequências. Dividida em dois episódios de longa duração, essa OVA reelabora os eventos da série de TV Genesis of Aquarion em vez de repeti-los.