Killy e Cibo aparecem ao lado de Dhomochevsky e Iko dentro de uma escola japonesa comum em vez da megaestrutura em ruínas da série principal, com suas dinâmicas levadas para a comédia em vez do horror de sobrevivência. Dois capítulos, Netsphere Engineer e BLAME!², fogem do formato paródico e funcionam como sequências diretas da história do mangá original de Blame!, ao lado de one-shots independentes e vinhetas de horror corporal sem relação com nenhum dos dois.