Shinji Ikari e Asuka Langley Soryu são inseparáveis desde a infância e vivem se provocando, como bons amigos de longa data, até que a nova aluna transferida Rei Ayanami aparece na sala e desequilibra tudo. Enquanto Shinji tenta entender o que sente por cada uma delas, os adultos ao redor, incluindo os próprios pais dele, não param de se meter no assunto. Esse mangá transporta o elenco de Evangelion para um mundo em que os pais de Shinji estão vivos e as batalhas mecha nunca acontecem, trocando tudo por uma comédia romântica escolar.