Jirou Azuma, de dezessete anos, mora com o avô, o último de um clã shinobi, e tem o dom de falar com os animais, habilidade que usa mais para proteger bichos de rua do que pessoas. Salvar um gato preto chamado Ragou custa a vida de Jirou, mas o gato é na verdade um mononoke, um espírito que o salva cedendo o próprio poder. Essa troca puxa Jirou para dentro da Black Torch, uma unidade do governo que caça os mononoke ainda em guerra com a humanidade, e Ragou passa a acompanhá-lo como um parceiro que ele nunca pediu.