Roxas acorda sem memória de quem era, recrutado para a Organização XIII logo depois de Sora quase se sacrificar para salvar Kairi. Enquanto treina ao lado do veterano Axel e de uma recruta silenciosa chamada Xion, Roxas começa a se perguntar que tipo de ser ele realmente é. Este mangá adapta a história do videogame e preenche os dias entre o desaparecimento de Sora e seu retorno.