Naoya entrega COMPs portáteis ao primo Kazuya e a dois amigos, e logo os três começam a receber o Laplace Mail: vídeos curtos que mostram como as pessoas ao redor deles vão morrer. Os aparelhos escondem um programa de invocação de demônios; quando os demônios se espalham por Tóquio, o governo fecha a cidade com os três lá dentro. Este mangá acompanha o Devil Survivor da Atlus ao longo desse cerco, com o trio tentando quebrar as mortes anunciadas pelo Laplace Mail.