Terminado su primer año en First High, Tatsuya Shiba y su hermana Miyuki viajan con sus amigos a la villa familiar en las islas Ogasawara para pasar las vacaciones de primavera. La calma se rompe cuando aparece huyendo una joven llamada Kokoa, una de las nueve magas modificadas genéticamente de la serie Watatsumi que escapó del centro donde la crearon. Mientras los perseguidores llegan a las islas, Tatsuya termina protegiéndola. Esta película de historia original sigue a la serie.