Con el Negaverso ya derrotado, Serena Tsukino y las demás guardianas han vuelto a su vida cotidiana, hasta que dos alienígenas, Ail y An, llegan para drenar la energía humana y alimentar su árbol moribundo, el Makaiju. Sus monstruos Cardian obligan a Serena a recuperar sus poderes como Sailor Moon, ahora con la ayuda del enmascarado Caballero de la Luna. Esta segunda temporada arranca con el arco autoconclusivo del Makaiju.