Kun, de cuatro años, vive con su padre arquitecto y su madre, que trabaja, en una casa escalonada construida alrededor de un árbol en Yokohama. Cuando sus padres llegan con una hermanita recién nacida llamada Mirai, Kun pierde toda la atención a la que estaba acostumbrado y la toma contra el bebé. En el jardín de la casa empieza a encontrarse con visitantes del pasado y el futuro de su familia, entre ellos la propia Mirai ya adolescente, que lo guían por experiencias que cambian cómo ve a quienes lo rodean.