Tatsuya y Miyuki Shiba comienzan su segundo año en First High, donde Tatsuya asume como vicepresidente interino del consejo estudiantil y se incorpora al nuevo Curso de Ingeniería Mágica. Un alumno de primer año llamado Shippou Takuma, heredero de una de las Familias Numeradas de élite, desafía a los hermanos desde el primer día e intenta reclutar a sus aliadas Honoka y Shizuku. Esta tercera temporada adapta los arcos Double Seven y Steeplechase.