Genshiken, abreviatura de la Sociedad para el Estudio de la Cultura Visual Moderna, es un club universitario dedicado al manga, el anime, los videojuegos y el doujin. Kanji Sasahara llega a la Universidad Shiiou ocultando sus gustos otaku y termina inscribiéndose ahí. Entre habituales como el veterano sin filtro Madarame y el fan empedernido Kousaka, aprende a aceptar sus aficiones. Saki Kasukabe, la novia de Kousaka, siempre a la moda y única no otaku, acaba arrastrada al club y, a regañadientes, a sus convenciones y su cosplay.