Criado en las zonas de guerra de Afganistán, Sousuke Sagara maneja mejor un rifle que un cuaderno, y ya es soldado de Mithril, una organización antiterrorista encubierta. Su nueva misión lo manda a una preparatoria japonesa disfrazado de alumno trasladado: debe cuidar a Kaname Chidori, una chica de carácter explosivo que, sin saberlo, es una de los Whispered y carga un conocimiento muy codiciado. Sousuke la vigila sin contarle nada del peligro, y sus reflejos de combate chocan sin parar con la rutina del salón de clases.