Cada persona nace como uno de tres Doppeliner idénticos que comparten en secreto un mismo destino, y unos guardianes llamados Mototsumitama mantienen el mundo en el equilibrio de la Coexistencia. Keita Ibuki, programador independiente de videojuegos en Tokio, se entera de todo así: una herida mortal casi acaba con él, y Kuro, una joven Mototsumitama, lo salva sellando un contrato entre ambos. Con su amiga de la infancia Akane Sano de por medio, Keita queda metido en la ofensiva que el Grupo Kaionji lanza contra ese equilibrio.