Angelina «Lina» Kudou Shields huye a Japón justo cuando los Parásitos empiezan a invadir de nuevo, y una rebelión en la base STARS de Nuevo México deja acorralado a Canopus, el segundo al mando de la unidad, sin ningún lugar seguro al que recurrir. Tatsuya y Miyuki Shiba intervienen para guiar a Lina hacia la isla Miyaki, una isla volcánica frente a la costa que administra la familia Yotsuba, con la esperanza de mantenerla fuera de alcance mientras la crisis amenaza con estallar en una guerra mágica abierta.