El Sistema Sibyl escanea la mente de cada ciudadano japonés y le asigna un Psycho-Pass: un número que marca a cualquiera cuya tendencia criminal cruce el límite antes de que cometa un delito. En ese Japón, Akane Tsunemori se incorpora como novata a la División 1 de la Oficina de Seguridad Pública. El manga sigue sus primeros casos cazando criminales latentes junto a sus Ejecutores, mientras aprende a confiar en un sistema que dice ver culpas que todavía nadie cometió.