El estudiante de preparatoria Takao Akizuki falta a clases las mañanas de lluvia para dibujar diseños de zapatos en el jardín Shinjuku Gyoen de Tokio, donde se topa una y otra vez con Yukari Yukino, una mujer mayor que nunca le dice su nombre. Ninguno de los dos habla de lo que realmente les pasa, pero esos encuentros silenciosos bajo la lluvia se convierten en el único lugar donde pueden ser sinceros sin decir gran cosa. Este manga adapta la película El jardín de las palabras de Makoto Shinkai y agrega material nuevo, incluido un final extendido que no aparece en la película.