Los cinco integrantes del Club de Investigación Cultural de la academia Yamaboshi, Taichi Yaegashi, Himeko Inaba, Iori Nagase, Yui Kiriyama y Yoshifumi Aoki, empiezan a intercambiar cuerpos entre sí sin que ninguno logre explicar por qué. Detrás del fenómeno está una entidad que se hace llamar Heartseed, que lo usa para sacar a la luz secretos, enamoramientos y miedos que los cinco preferirían mantener ocultos, poniendo a prueba si su amistad resiste saber tanto unos de otros. Este manga adapta la serie de novelas ligeras de Kokoro Connect.