En la isla de Hinomoto, donde una plaga de criaturas no-muertas llamadas Kabane solo puede eliminarse perforando un corazón blindado de hierro que ninguna arma común alcanza, el herrero Ikoma construye su propia arma perforante en la estación Aragane. Cuando la estación cae ante un enjambre de Kabane, Ikoma es mordido y sobrevive convertido en Kabaneri, un híbrido humano-Kabane, y encuentra una aliada en Mumei, otra Kabaneri que lucha por mantener con vida a los sobrevivientes de la estación a bordo del tren blindado Koutetsujou. Este manga adapta el anime Kabaneri of the Iron Fortress.