Los días de Shirou Emiya siguen una rutina tranquila que gira en torno a su compañera de clase Sakura Matou, que entra a su casa cada mañana para cocinarle, hasta que la Quinta Guerra del Santo Grial estalla sin previo aviso. Sakura empieza a enfermar de forma misteriosa, y Shirou descubre que ella está metida en el conflicto como Master en contra de su voluntad, lo que convierte una guerra de la que no quería saber nada en la única manera de protegerla. Este manga adapta Heaven's Feel, la tercera y última ruta de la novela visual original Fate/stay night de TYPE-MOON, junto a las adaptaciones anteriores de Fate/stay night y Unlimited Blade Works.