Tras sobrevivir a un ataque Savage, Hayato Kisaragi ingresa a Little Garden, una academia montada sobre un enorme buque de guerra, para entrenarse en el uso del Hundred, el único armamento capaz de dañar a los invasores. Su compañero de cuarto, Emile Crossfode, parece conocerlo de algún lado y no dice de dónde, mientras que Claire Harvey, presidenta del consejo estudiantil y la Slayer más fuerte a bordo, lo desafía a un duelo apenas llega. Hayato pelea tanto por dinero como por gloria: el tratamiento de su hermana depende de ello.