Poco después de la crisis que casi destruye su reino, Leon Fou Bartfort y Marie, otra reencarnada como él, se enteran de que el juego tiene una secuela, y la noticia los inquieta: si la historia continúa, podría haber otra catástrofe esperando en algún otro lugar. Los dos se inscriben como estudiantes de intercambio en una academia de la República de Alzer para averiguar quién es la verdadera heroína de esa secuela, y la búsqueda se reduce a las gemelas Noelle y Leila, cada una de las cuales encaja solo a medias con la descripción. El manga retoma la historia justo después de la serie original y traslada al elenco a un escenario nuevo.