Nada más matricularse en la Academia Ohtori, Utena Tenjou sigue buscando al príncipe que la consoló de niña, pero termina arrastrada a los extraños rituales del consejo estudiantil en torno a su compañera Anthy Himemiya. Al vencer en un duelo al consejero Kyouichi Saionji, Utena queda comprometida con Anthy como la 'Novia de la Rosa', y nuevos duelos contra Touga Kiryuu, Juri Arisugawa y Miki Kaoru ponen a prueba cuánto vale realmente reclamarla. El manga se publicó junto con el anime de 1997, pero desarrolla su propia versión de la historia.