El Dr. Yung invita a Ash, Brock, May y Max a su laboratorio aislado para mostrarles el Mirage System, una tecnología capaz de recrear Pokémon extintos y legendarios a partir de datos digitales. La demostración se descontrola cuando el propio sistema secuestra a Yung y un enmascarado que se hace llamar el Amo del Mirage toma el control, decidido a crear un Pokémon sin puntos débiles con el código capturado de Mew. El grupo de Ash tiene que entrar en la mansión y liberar a Yung y a los Pokémon atrapados antes de que lo consiga.