Riki Naoe lleva tiempo temiendo el día en que su grupo de amigos de la infancia se separe, y cuando Kyousuke Natsume, el líder, empieza a buscar trabajo, responde anunciando que van a formar un equipo de béisbol llamado los Little Busters. Completar la plantilla implica reclutar nuevos integrantes por toda la escuela, y las amistades que nacen alrededor del equipo resultan ser el verdadero sentido de todo. Este manga es la adaptación oficial al cómic del anime de televisión Little Busters!, y la historia continúa en su secuela, Last of Refrain.