Keiichi Maebara acaba de mudarse a Hinamizawa, un pueblo remoto donde pasa tardes despreocupadas jugando con sus compañeras de clase Rena Ryugu, Mion Sonozaki, Rika Furude y Satoko Hojo. Cada año, durante el Festival Watanagashi, una cadena de asesinatos y desapariciones golpea al pueblo, y todos los casos apuntan a la deidad local Oyashiro-sama. Al enterarse, Keiichi ve que las amigas que creía conocer empiezan a actuar de forma extraña y ya no logra distinguir si el peligro viene de fuera o está sentado junto a él.