En 2112, Teppei Sugou es piloto de drones de la 15ª Fuerza de Tareas Integrada del Ejército de Defensa y cubre desde el aire a un escuadrón de tierra en Okinawa bajo el indicativo First Guardian, hasta que la operación sale mal y la unidad de su comandante, Itsuki Ootomo, queda abandonada a su suerte. Tres meses después, una aeronave no tripulada abre fuego contra el Ministerio de Defensa en Tokio y los drones se rastrean hasta la terminal militar del propio Sugou. La inspectora Risa Aoyanagi y el Ejecutor Tomomi Masaoka llegan a su base para averiguar qué pasó en realidad.