Tres años después de El Contraataque de Char, el estudiante común Banagher Links se cruza con Audrey Burne, una chica que intenta evitar una guerra por el secreto mejor guardado de la Fundación Vist: la Caja de Laplace. Su encuentro con el misterioso Unicorn Gundam, la llave de esa caja, lo arrastra a una guerra abierta entre la Federación Terrestre y los Sleeves, la facción remanente de Neo Zeon liderada por el enmascarado Full Frontal. Este manga adapta las novelas originales de Gundam Unicorn.