Un desastre sísmico conocido como el Gran Levantamiento partió Yokohama en dos hace veintidós años, dejando aislado un territorio llamado Lost Ground. Ahí sobrevive Kazuma Torisuna, un mercenario sin ley que usa Shell Bullet, un Alter capaz de convertir su brazo en un arma viva, para ganarse la vida. Todo se complica cuando Ryuho, agente de la organización HOLY, entra al Lost Ground cazando Alters no autorizados y choca de frente con Kazuma, arrastrándolo a la guerra entre los marginados de Lost Ground y el orden que impone el Mainland.