La tercera temporada de Bungo Stray Dogs arranca con un arco de flashback: los días de Osamu Dazai en la Port Mafia, su primer encuentro con Chuya Nakahara y el caso que terminó por unirlos. En los episodios del presente, tanto la Armed Detective Agency como la Port Mafia se ven envueltas en una conspiración orquestada por Fyodor Dostoevsky, líder de un grupo llamado Rats in the House of the Dead.