Tres años después de que una nave nodriza alienígena se instalara sobre Tokio sin ninguna explicación, las estudiantes Kadode Koyama y Ouran Nakagawa solo intentan terminar su último año antes de graduarse. La calma de Kadode contrasta con el carácter más directo de Ouran mientras su compañero Keita Ooba las arrastra a rumores en línea sobre lo que realmente quiere la nave. A su alrededor, los adultos discuten sobre evacuaciones, armamento y si el gobierno dice la verdad. Esta adaptación cinematográfica en dos partes del manga de Inio Asano sigue el año escolar de las chicas justo debajo de una amenaza que nadie logra explicar.