La segunda temporada del remake en CGI de Saint Seiya de Toei arranca justo después de las primeras batallas de los Caballeros de Bronce, cuando Seiya y sus compañeros enfrentan una nueva amenaza dirigida contra la diosa Saori, la reencarnación humana de Atenea. Para llegar hasta ella y detener lo que se avecina, los Caballeros deben abrirse paso por las Doce Casas del Santuario, cada una custodiada por un Caballero de Oro mucho más fuerte que cualquier rival anterior. Esta temporada del ONA adapta el arco de las Doce Casas de Oro del manga y continúa directamente desde el final de la primera temporada.